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应用昆虫学报 2015
云南切梢小蠹气味结合蛋白的同源模建Keywords: 气味结合蛋白,同源模建,三维结构,云南切梢小蠹 Abstract: 【目的】为了研究云南切梢小蠹tomicusyunnanensis气味结合蛋白(odorantbindingproteins,obps)参与其嗅觉识别过程的机理奠定基础,本文对云南切梢小蠹obp进行了同源模建及评价分析。【方法】采用同源模建方法构建了云南切梢小蠹obp的三维结构,并利用procheck、verify_3d和errat等方法评估了构建模型的可靠性。【结果】对优化后的模建蛋白的结果分析发现,序列中有6个保守的半胱氨酸位点,具有气味结合蛋白的典型特征,并且procheck、verify_3d和errat对模型的评价分数较高,结构具有很高的可能性。【结论】基于已知的同源蛋白结构信息和模建蛋白的一级序列信息,预测序列已知但结构未知的蛋白空间结构,为今后研究该云南切梢小蠹气味结合蛋白的功能结构域奠定基础。
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