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应用昆虫学报 2013
线粒体基因组数据的分析方法和软件Abstract: 线粒体基因组的研究已经普及,其正确的拼接和注释是所有后续研究的基础。本文以stadenpackage软件为主介绍了拼接和注释的线粒体基因组的方法,同时介绍了其他常用的拼接软件contigexpress、dnaman、dnastar、bioedit和sequencher,以及利用不同软件(包括dogma、mosas、mitos、gobase、ogre、mitozoa、trnascanse、arwen、blast和mitfi等)对线粒体基因组中的蛋白质编码基因、rrna、trna和a+t富集区进行注释的方法,最后介绍了利用mega5软件分析线粒体基因组的组成、sequin软件提交序列和线粒体基因组数据绘图工具(cgview、mtviz和ogdraw)。
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