基于rna-seq分析ras1ca在家蚕后部丝腺过表达对细胞周期通路基因的影响

【目的】本文旨在挖掘野生型家蚕bombyxmori和ras1ca过表达转基因家蚕后部丝腺中的转录本差异，分析和验证细胞周期通路中的差异表达基因，从而探讨ras1ca过表达转基因家蚕提高蚕丝产量的分子机制。【方法】利用转录组学比较野生型和ras1ca过表达转基因家蚕后部丝腺中的基因转录本差异，经实时荧光定量pcr（qrt-pcr）验证。【结果】野生型家蚕和ras1ca过表达转基因家蚕后部丝腺组织中有2636个差异表达基因，其中细胞周期信号通路中有42个差异表达基因，包括细胞周期依赖性激酶（cdk）、细胞周期素（cyclin）以及转录因子等。通过qrt-pcr检测cdk1、cyclind1、cyclind2、cdc7、cdh1、dp-1,2等6个基因在野生型和ras1ca过表达转基因家蚕后部丝腺组织中的相对表达量，发现转基因家蚕中的表达量均显著高于野生型（p<0.05），其中cyclind2的表达差异极显著（p<0.01）。qrt-pcr结果与转录本差异一致，表明ras1ca过表达后，能够促进细胞周期通路基因的表达。【结论】野生型家蚕和ras1ca过表达转基因家蚕后部丝腺中有大量差异表达基因，且ras1ca能够在转录水平上调控细胞周期通路，影响后部丝腺组织的细胞分裂和器官生长，从而促进蚕丝蛋白的合成。