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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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Individual genomic DNA isolation of Entomogenous nematodes: the Deladenus study case

Keywords: DNA extraction , Protocol , Woodwasp , Sirex Noctilio Extra o de DNA , Protocolo , Vespa-da-madeira , Sirex Noctilio

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Abstract:

Populational studies involve single individual DNA extraction in order to grant further genotyping data. In the case of some parasitic nematodes, the reduced dimensions and high individual number per infestation makes individual genotyping a difficult task. Aiming the development of a protocol we performed adjustments in available methods in order to acquire the best gain in purity and concentration of genomic DNA. Single specimens were digested in Worm Lysis Buffer and submitted to PCR amplification as a concept test. It was possible to obtain good amount and concentration of DNA from individuals. Quality was sufficient to grant subsequent ITS1 sequencing. Estudos populacionais envolvem a extra o de DNA de um único indivíduo para permitir a genotipagem. No caso de alguns nematoides parasíticos, suas dimens es reduzidas e o grande número de indivíduos por infesta o tornam a genotipagem difícil. Com o objetivo de desenvolver um protocolo, foram feitos ajustes em métodos já disponíveis, visando melhor ganho em pureza e concentra o de DNA gen mico. Espécimes foram digeridos em tamp o de digest o de verme e submetidos à amplifica o por PCR, como prova de conceito. Foi possível a obten o de boa quantidade e concentra o de DNA de indivíduos. A qualidade foi suficiente para garantir o sequenciamento da regi o ITS1.

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