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自然科学进展 2008
坛紫菜(Porphyra haitanensis)SRAP分子标记体系的构建及种质材料的遗传分析Keywords: 坛紫菜,正交设计,SRAP,遗传多样性,坛紫菜,Porphyra,SRAP,分子标记,体系,种质材料,信息,遗传变异,遗传育种,遗传多样性,存在,结果,聚类分析,UPGMA,配对法,非加权,应用,多样性指数,Shannon,杂合度 Abstract: 利用正交设计对影响坛紫菜SRAP标记分析的5个因素(模板DNA,Mg^2+,Taq酶,引物,dNTP浓度)在4个水平上进行优化,筛选出各反应因素的最佳水平,建立了坛紫菜SRAP标记分析的最佳反应体系.然后利用该体系对15个坛紫菜种质材料进行了遗传多样性分析,筛选出15对可以扩增出清晰稳定条带的引物组合,共获得244个位点,其中184个位点具有多态性,占75.4%.15个供试材料间的平均遗传距离为0.2904,有效等位基因数为1.3758,期望杂合度为0.2303,Shannon多样性指数为0.3559.应用非加权成组配对法(UPGMA)对它们进行了聚类分析.结果表明供试的坛紫菜种质材料间存在着较高的遗传多样性,这为后续的坛紫菜遗传育种提供了丰富的遗传变异信息.
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