水稻mRNA多聚腺苷化信号位点的序列分析

大部分真核生物mRNA的加工涉及到mRNA前体的分裂／多聚腺苷化，在3’-末端形成多聚腺苷酸（poly（A））尾巴．为了研究水稻mRNA前体多聚腺苷化过程所必需的poly（A）加尾信号、下游调控元件和poly（A）位点等序列的特点，用3’-末端带有poly（A）的EST与全长cDNA序列进行比较，建立了一个来自9953个基因的、覆盖12969条poly（A）位点两侧各40碱基序列的数据库．结果发现，只有7．9％的mRNA使用AAUAAA作为加尾信号，超过60％使用AAUAAA的1～2个碱基变化的序列作为加尾信号，11．5％的mRNA使用AAUGAA及其单碱基变化的加尾信号．在约25％的mRNA的3’．末端存在多个poly（A）位点．在90％的mRNA前体的加尾信号下游都能检测到富含U／GU的调控元件，尤其在以AAuAAA的多碱基变化序列作为加尾信号的mRNA前体中，半数以上都能在poly（A）位点两侧检测到下游调控元件．而且，这些调控元件的位置对poly（A）位点的选择有限制作用．总之，虽然水稻mRNA加尾信号的保守性较低，但大量下游调控元件的存在保证了多聚腺苷化过程的正常进行．