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环境工程学报 2011
Comparative study of DNA extraction methods of microorganisms in river sediment
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Abstract:
提取河流沉积物中DNA是研究河流沉积物微生物多样性的难点之一,实验开发了一种酚与SDS的DNA提取方法,与OMEGA和BioDee 2种DNA提取试剂盒方法进行了比较,并通过DNA纯度、PCR扩增结合16S rDNA克隆文库检验对几种方法进行了评价。结果表明,OMEGA DNA提取试剂盒法方法简单,提取的DNA纯度较高,酚+SDS法用时较长,DNA提取量大,纯度较低。BioDee试剂盒提取量最小,虽然对PCR结果没有影响,但不能满足沉积物微生物多样性分析的要求。OMEGA DNA提取试剂盒法和酚+SDS法可分别用于PCR扩增、克隆文库、DGGE等的后续实验。