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海洋与湖沼 2010
CONSTRUCTION OF cDNA LIBRARY WITH APOSTICHOPUS JAPONICUS CULTURED IN THE SOUTH AND SEQUENCE ANALYSIS OF ITS TROPOMYOSIN GENE
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Abstract:
以南移养殖的刺参为实验材料, 采用非均一化的 Oliga-dT 引物定向克隆技术构建了南移刺参混合组织的 cDNA 文库。对文库质量的分析结果表明, cDNA 文库的库容量为 2.2×107cfu, 重组率达95.8%, 平均插入片段长度750bp左右。 挑取cDNA克隆进行5’端测序, 成功测序185个反应, 分析得到 136 个单基因簇(Unigene), 其中包括 40 个重叠群(Contigs)、96 个单拷贝 EST (Singletons)。结果表明, 克隆南移养殖的刺参原肌球蛋白(tropomyosin, Trp) cDNA 全长序列为 1112bp, ORF 编码284 个氨基酸, 其预测蛋白的分子量为 33.27kDa, 等电点为 4.56。该氨基酸序列与紫石海胆、南极大磷虾、锯缘青蟹、文昌鱼、河蟹、家蚕同源性分别为 62%、51%、46%、49%、47%、46%。