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ISSN: 2333-9721
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MICROSATELLITE LOCI OF PORTUNUS TRITUBERCULATUS: ISOLATION AND CHARACTERIZATION
三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)微卫星位点的分离和序列分析

Keywords: Microsatellite (SSR),Magnetic-bead enrichment method,Portunus trituberculatus
微卫星
,磁珠富集法,三疣梭子蟹

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Abstract:

采用磁珠富集法,利用生物素标记的(GT)15寡核苷酸探针从三疣梭子蟹基因组DNA的Sau3A1酶切的500-1000bp片段中筛选微卫星序列.洗脱的杂交片段克隆到PMD18-T载体上构建富集微卫星基因组文库后,通过PCR筛选检测出阳性克隆进行测序.在56条测序序列中有49条非冗余序列包含有重复次数不少于5次的微卫星位点,阳性序列比例达到87.5%.其中perfect类型微卫星最大的重复次数为47次.在47条非冗余序列中,共有40条(85.1%)微卫星重复序列两端有侧翼序列能够进行引物设计.本研究中筛选的微卫星位点将为下一步的三疣梭子蟹种群遗传结构分析、经济性状的QTL定位提供遗传标记.

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