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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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THE GENETIC DIVERSITY AND PHYLOGENETICANALYS OF ITS1 IN MITOCHONDRIAL DNA OF FOUR POPULATIONS OF PORTUNUS TRITUBERCULATUS
三疣梭子蟹(Portunustri tuberculatus)4个野生群体ITS1序列分析及系统进化分析

Keywords: Portunus trituberculatus,ITS1,Genetics diversity,Phylogenetic
三疣梭子蟹
,ITS1,遗传多样性,系统进化

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Abstract:

对我国沿海4个野生群体三疣梭子蟹的核糖体RNA转录单元内间隔区ITS1基因片段进行克隆和测序,获得长度为515—571bp的ITS1核苷酸序列,在4个群体的三疣梭子蟹中共检测到变异位点56个,多态位点比例为9.5%,其中简约信息位点25个,共检测到40种单倍型。通过统计单倍型多态性、平均核苷酸差异数和核苷酸多样性指数,结果显示:舟山群体多样性指数最高,其次是鸭绿江口群体和海洲湾群体,莱州湾群体最低。在三疣梭子蟹ITS1序列中共发现5种微卫星位点,AMOVA分析结果显示4个群体间的遗传差异显著。另外,将本研究所得序列结合GenBank数据库中十足目12种蟹ITS1序列构建系统进化树,系统树显示同属的不同种各自聚支,与形态学分类吻合。

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