利用比较基因组学方法对猪BAC DNA序列分析来研究抑肌素基因的调控

抑肌素(GDF8,MSTN)是调控骨骼肌发育的TGF-β超家族的一员.作为负调节因子,抑肌素通过控制肌纤维的大小和数量来调控骨骼肌的发育.为了更深入研究它的表达和调控模式,我们利用比较基因组学方法对一个大约170kb的猪BAC序列与人和小鼠的相应序列进行了分析,这段基因组序列的特点是富含分散型重复而G+C含量较低.抑肌素基因的同源性在猪、人和小鼠3种生物之间非常高,正如所希望的,在人与猪之间的同源性高于它们与小鼠的同源性.一个有意思的特征是在抑肌素启动子CCAAT盒下游有两个TA盒,进一步分析表明TA盒1负责在人、猪中转录,而TA盒2在小鼠中起作用;另一个的特征是在猪抑肌素3′UTR有两个polyA信号序列(AATAAA).进而,我们在进化保守区域分析到许多潜在的转录因子结合位点,它们可能与抑肌素的调控有关.许多潜在的转录调控因子在肌肉的发育中起重要作用,暗示着抑肌素与这些因子的复杂相互作用可能是正常肌肉发育所必需的(文中所提到的序列已提交到GenBank,序号为AY208121).