基于芸香科的植物通用DNA条形码研究

植物DNA条形码研究是近10年来进展最迅速的学科之一, 其通用序列的筛选一直是该领域研究的热点问题. 2009年, 生命条形码联盟植物工作组推荐rbcL+matK组成复合序列作为植物通用条形码, 但其研究对象中近缘属、种较少, 且物种水平鉴定成功率仅为72%, 所以仍在进行验证和新序列的研究工作. 本研究选取nrDNA ITS2序列, 利用其具有Ⅱ级结构的特性、通过不同物种类型模型判定全长, 将其和目前热点候选序列(matK, rbcL, psbA-trnH, rpoC1, ycf5)及nrDNA ITS序列针对芸香科72属192种300个样本进行比较, 试图在同一科属下更多近缘种存在时, 真实判定候选序列的鉴定能力. 结果表明, 自行设计引物的ITS2序列具有较好的PCR扩增和测序成功率, 在所考察的候选序列中具有最大的种间变异和较小的种内变异, 且两者存在极显著差异, 同时物种鉴定成功率最高, 各评价指标均优于其他候选序列. 证实ITS2序列在单一科属内的“高效性”, 故推荐其作为植物DNA条形码通用序列之一.