玉米耐渍功能基因组分析及相关基因Sicyp51的鉴定与克隆

选用耐渍性有明显差异的玉米自交系Mol7和Hz32,对二叶一心期的幼苗进行淹水处理,构建了这两个材料各自正向和反向的SSH(suppression subtractive hybridization)文库.从SSH 文库中筛选到105个阳性克隆;利用处理及对照mRNA与Mol7全生育期cDNA芯片分别杂交, 得到57个3倍以上表达差异的克隆.对所有162个克隆进行序列分析,结果表明:所有差异表达的克隆代表85个TUGs(tentative unique genes),这些TUGs主要参与厌氧代谢、逆境自我保护、信号传导、细胞结构和能量代谢等生理生化途径,同时还包括41个未知功能的cDNA,说明玉米根系对淹水胁迫响应涉及到复杂的代谢反应.对从Mol7和Hz32中筛选到的差异表达克隆进行比较分析发现,在淹水条件下,耐渍性不同的材料具有不同的耐渍相关基因的表达模式.利用Northern及RT-PCR检测了部分阳性克隆的表达谱,并克隆到一个与耐渍相关的新基因(Sicyp51).