疟蚊基因组中新硒蛋白的计算机识别

硒蛋白的生物合成取决于硒代半胱氨酸插入蛋白质的过程.TGA码既是终止码、又可翻译成硒代半胱氨酸,这使普通基因注释软件无法正确预测硒蛋白,导致现有数据库中许多物种的硒蛋白被错误注释或丢失.本研究基于已公布的疟蚊基因组预测信息、采用PERL语言编程,对疟蚊基因组中的硒蛋白进行了计算机检索与分析.结果表明:以TGA码终止的基因有11365条,其中具有SECIS结构的基因有918条,同时具有半胱氨酸同源类似物的基因58条.再经Sec侧翼序列比对,最终检索到具有硒蛋白全部特点的基因7条.从硒蛋白的基本生物功能推测,冈比亚疟蚊基因组中存在的新硒蛋白可能与疟蚊的氧化耐受特性及其相关蛋白的调控相关联.因此,研究疟蚊硒蛋白将为干涉疟蚊带菌能力、从蚊媒传播途径防止疟疾提供理论基础.