原核生物系统发生学与分类学的一致性: 组份矢量树与原核生物分类系统的详尽比较

截至2006年12月31日,NCBI共有432个原核生物的全基因组可供下载.基于这些数据,我们用组份矢量方法构建了原核生物的进化树.最新的《伯杰系统细菌学手册》的在线大纲体现了细菌学家的分类系统.我们对两者从各个分类单元、各个分支进行了详尽的比较.组份矢量方法所得到的亲缘树和伯杰分类系统在整体结构和绝大多数的细微分支上都相当一致.同时,两者的多数不同之处也已经在一定程度上为生物学家所知,从而为原核生物分类系统的修正提供了一定的启示.本文重点阐述两者之间分岐之处的生物学含义,而不再对居主导地位的相同之处做详细叙述.