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ISSN: 2333-9721
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遗传  2008 

Cloning and analysis of Lyb gene from Lampetra japonica
日本七鳃鳗(Lampetra japonica)Lyb基因的克隆与分析

Keywords: 日本七鳃鳗,Y-box基因,cDNA末端快速扩增(RACE),序列分析,系统发育分析

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Abstract:

采用RT-PCR和RACE技术,从日本七鳃鳗(Lampetra japonica)口腔腺、肝脏中分离获得了3条Y-box基因序列,分别命名为却61、Ly易2和Ly易3,生物信息学分析其编码的蛋白质序列长度分别为331、181和171个氨基酸残基。采用DNAMAN软件,将七鳃鳗的3个Y-box蛋白氨基酸序列与海鞘、斑马鱼、清鲻、河豚鱼和小鼠Y-box蛋白进行同源性分析,结果显示他们共有一个保守的冷休克结构域,其中包含两个RNA结合基序RNP-1和RNP-2,表明获得的Lyb基因属于Y-box基因家族成员。此外,从Swiss—Prot下载了经实验验证过的Y-box蛋白序列数据,结合实验克隆得到的Lyb基因所编码的氨基酸序列构建系统发育树,发现Y-box基因在有颌类出现以前只有一种类型,有颌类出现以后,Y-box基因分化成YB1、YB2和CSDA三种类型。

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