Study on single nucleotide polymorphisms of H -FABP gene in sheep
绵羊H-FABP基因单核苷酸多态性的研究

以小尾寒羊(48只)、宁夏滩羊(121只)、滩寒杂交羊F1(23只)、无角陶塞特(48只)、萨福克(24只)5个绵羊群体为实验材料,利用PCR-SSCP和DNA测序技术对心脏型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基(GenBank登录号:AY157617)外显子2和内含子2部分序列进行单核苷酸多态性(SNPs)检测及遗传多态性分析.结果表明:(1)引物2的PCR扩增产物中存在981(G/A)、1014(A/C)、1019(T/C)和1058(-/G)4个SNP位点,表现为AA、BB、CC、AB、AC、BC、AD、CD和BD 9种基因型,其中AA为优势基因型.经X2检验后,除滩羊和萨福克羊外,其他群体的基因频率和基因型频率均处于Hardy-Weinberg平衡状态.群体遗传多态性分析表明:宁夏滩羊、小尾寒羊和无角陶塞特羊3个群体中的多态信息含量(PIC)均处于0.25和0.50之间,为中度多态,萨福克羊和滩寒杂交羊F1为低度多态(PIC<0.25),表明脂肪酸结合蛋白基因在不同绵羊品种中具有单核苷酸多态性,可以进一步作为候选基因来分析其与肌内脂肪含量性状的关联性.(2)引物4的PCR扩增产物中检测到1个SNP多态位点为2407(T/C),表现为HH、Hh和hh3种基因型,基因型频率大小为HHHhhh,经X2检验后,在滩羊和无角陶塞特羊中均为达到Hardy-Weinberg平衡状态,其多态信息含量均为低度多态(PIC<0.25),而在小尾寒羊,滩寒杂交羊F1和萨福克羊均没有多态出现.