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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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Development of whole-genome DNA microarray of Vibrio parahaemolyticus and evaluation of the microarray quality
副溶血性弧菌全基因组DNA芯片的研制和芯片质量的评价

Keywords: Keywords Vibrio parahaemolyticus,DNA microarray,comparative genomics,evolutionary genomics,functional genomics
关键词
,副溶血性弧菌,DNA芯片,比较基因组学,进化基因组学,功能基因组学

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Abstract:

摘要 目的 研制副溶血性弧菌全基因组芯片,建立芯片杂交方法,并对芯片质量进行评价。方法 利用副溶血性弧菌全基因组序列,挑选出4770条基因,PCR扩增各基因并将PCR产物纯化,点样制备芯片;设计了两个质控杂交组合,采用双色荧光杂交策略,对芯片质量进行评价;PCR方法验证部分芯片结果。结果 芯片杂交与理论预期结果以及PCR验证结果完全一致。结论 成功的研制了一批质量良好的副溶血性弧菌全基因组DNA芯片,并建立了基于DNA芯片的副溶血性弧菌比较基因组学技术平台,建立了一套系统的芯片数据分析的标准方法。

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