Predominant strains of polycyclic aromatic hydrocarbon-degrading consortia from deep sea of the Middle Atlantic Ridge
大西洋洋中脊深海多环芳烃降解菌群的优势菌分析

摘要：【目的】为了分析大西洋洋中脊深海海水及表层沉积物中多环芳烃(PAHs)降解菌群中的优势菌。【方法】采用富集培养法和平板涂布法从深海样品中分离可培养细菌及PAHs降解菌。通过16S rRNA基因测序完成系统发育分析。采用变性梯度凝胶电泳（DGGE）及DNA测序分析降解菌群中的优势菌。【结果】总共分离到16株细菌，包括一株PAHs降解菌Novosphingobium sp. 4D。系统发育分析发现，可培养细菌中两个最大的类群分别与Alcanivorax dieselolei NO1A（5/16）和Tistrella mobilis TISTR 1108T（5/16）亲缘关系最近。DGGE结果表明，在菌群MC2D中菌株4L（以及4M、4N， Alcanivorax dieselolei NO1A， 99.21％）、4D（Novosphingobium pentaromativorans US6-1T，97.07％）和4B（以及4E、4H、4K，Tistrella mobilis TISTR 1108T，＞99％）是降解菌群中的优势菌。而降解菌群MC3CO中的优势菌是菌株5C（以及5H，Alcanivorax dieselolei NO1A，＞99％）、条带5-8代表的未培养菌株（Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444T，99.41%）、5J（Tistrella mobilis TISTR 1108T，99.52％）和5F（以及5G，Thalassospira lucentensis DSM 14000T，＜97％）。【结论】本研究发现在大西洋洋中脊深海海水及表层沉积物中Alcanivorax、Novosphingobium、Thalassospira、Tistrella属的细菌是PAHs降解菌群中的优势菌，其中的主要降解菌是Novosphingobium属的细菌。