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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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A putative NtcA-regulating gene,alr1390,in Anabaena sp. PCC 7120
鱼腥蓝细菌PCC 7120中一个受到NtcA调控的基因alr1390

Keywords: Anabaena sp,PCC 7120,NtcA,alr1390,Real-time RT-PCR,Electrophoretic mobility shift assays(EMSA)
关键词:鱼腥蓝细菌(Anabaena
,sp.,),PCC,7120,NtcA,alr1390,实时定量反转录PCR(Real-time,RT-PCR),电泳迁移率实验(Electrophoretic,mobility,shift,assays,EMSA)

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Abstract:

摘要: NtcA是鱼腥蓝细菌中一种重要的氮代谢调控蛋白质,参与异形胞的分化。许多受NtcA调控的基因都至少有一个保守的NtcA结合位点GTA-N8-TAC。经生物信息学分析,鱼腥蓝细菌PCC 7120 基因alr1390可能的转录起始位点的上游有一个保守的NtcA结合位点GTA-TAG TTTTC-TAC。【目的】为了鉴定alr1390和NtcA之间的关系,【方法】采用实时定量反转录PCR实验(Real-time RT-PCR)和电泳迁移率实验(Electrophoretic mobility shift assays, EMSA)对alr1390和NtcA之间的关系进行了分析。【结果】Real-time RT-PCR结果显示,alr1390的转录水平在野生型鱼腥蓝细菌PCC 7120中缺氮诱导后和诱导前持平,而在ntcA突变体中缺氮诱导12h后呈现上调趋势。但是EMSA实验中没有检测到明显的NtcA和alr1390启动子区片段结合的滞后带,却观察到一条拖带。【结论】这说明alr1390受到NtcA的调控。

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