Molecular Characterization of Tomato Yellow Leaf Curl China Virus and its Associated Satellite DNA Infecting Siegesbeckia orientalis
侵染稀硷的中国番茄黄化曲叶病毒及其卫星DNA全基因组结构特征

从云南红河稀硷上分离到病毒分离物Y64，全序列测定表明，Y64 DNA_A全长2730个核苷酸。基因组比较发现，Y64 DNA_A与中国番茄黄化曲叶病毒Y38分离物（TYLCCNV_［Y38］）同源性最高（99％），与中国番茄黄化曲叶病毒广西分离物（TYLCCNV）的同源性次之（96％），而与亚洲地区的其它双生病毒的同源性均在83％以下, 表明稀硷上的分离物Y64是TYLCCNV的1个分离物。利用DNAβ的特异性引物beta01和beta02，在病毒分离物Y64中扩增到卫星DNA分子（Y64β）。序列分析表明，Y64β全长1340个核苷酸，至少在其互补链上编码1个有功能的ORF（C1）。Y64β的全序列与TYLCCNV的各个分离物的卫星分子（Y38β、Y36β和Y8β）的同源性最高，分别为99.5％、99.5％和99.3％；与其它已报道的卫星DNAβ的同源性均低于66.4％。系统关系树研究表明，卫星DNAβ分子与其辅助病毒是共同进化的。