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微生物学报 2004
Determination and Analysis of 3′ End Genomic Sequence of Two Lily mottle virus Isolates Occurred in Zhejiang Province
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Abstract:
经RT-PCR扩增从浙江丽水的亚洲百合[Lilium cvs.(Asiatic Hybrids)]获得2个Potyvirus病毒分离物G和X的3′端cDNA片段,序列分析表明均为百合斑驳病毒(Lily mottle virus,LMoV);将12个来源于不同地区百合与郁金香上的Potyvirus分离物进行序列同源性比较和系统进化树分析,结果表明G、X、ML61、1229、2b、MD、HZ、J这8个分离物的CP核苷酸序列同源性达85.9%~100%,在进化树中聚集成簇,归为LMoV;2b2、TM和TBV1 3个分离物同源性达91.2%~99.3%,在进化树中也单独成簇,归为郁金香碎色病毒(Tulip breaking virus,TBV);2b3 与其它11个分离物同源性在74.4%~79.8%之间,为伦布兰特郁金香碎色病毒(Rembrandt tulip breaking virus,ReTBV)。Nib基因序列和3′UTR序列分析也表明G、X、ML61、1229、J、HZ这6个分离物之间亲缘关系较近,属于LMoV,而TM与它们的亲缘关系很远,属于TBV。LMoV分离物存在着两个群体,G和X分别处在第1群体和第2群体中,不表现地域相关性及寄主相关性。根据研究结果,将迄今世界各地侵染百合与郁金香的Potyvirus分离物归为LMoV、TBV和ReTBV 3个种。