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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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Typing of Vibrio parahaemolyticus by Repetitive Element Sequence-based PCR
副溶血性弧菌重复序列-PCR分型研究

Keywords: Vibrio Parahaemolyticus,Repetitive extragenic palindromic elements-PCR,Enterobacterial repetitive intergenic consensus sequences-PCR,Typing,Genetic relationship
副溶血性弧菌
,基因外重复回文序列-PCR,肠细菌基因间共有重复序列-PCR,分型,亲缘关系,副溶血性弧菌,重复序列,分型,研究,Element,parahaemolyticus,Vibrio,相似,群主,血清型,能力,分析,菌型,优势,树状图,软件,多态性,扩增条带,基因组,菌株

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Abstract:

利用基因外重复回文序列-PCR(REP-PCR)和肠细菌基因间共有重复序列-PCR(ERIC-PCR)技术,对副溶血性弧菌进行了分子分型研究和亲缘关系的探讨,并使用Hunter和Gaston方法计算分辨力指数.结果显示40株副溶血性弧茵分离株均可扩增产生可重复的DNA指纹图谱,并且不同菌株基因组DNA的扩增条带具有多态性.根据SPSS10.0软件得出的树状图结果,REP-PCR可以把40株茵分为21个型,分辨力指数可达到0.953,优势菌型为G1型;ERIC-PCR可将40株菌分成4个型,分辨力指数为0.5.研究显示重复序列-PCR方法可以用于该菌分型分析,REP-PCR具有较好的分型能力.在两种PCR的DNA指纹图谱中,血清型O1群与O3群主条带均非常相似,表明它们之间亲缘关系密切.

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