Comparative analysis of the mitochondrial DNA control region in Dongtingking crucian carp and other six strains of Carassius auratus
洞庭青鲫与其他六个鲫鱼品系线粒体DNA控制区的比较分析

运用PCR扩增、克隆、测序等技术, 在获得洞庭青鲫和彭泽鲫线粒体DNA控制区全序列的基础上, 对洞庭青鲫、彭泽鲫、普通鲫、红鲫、白鲫、A系和D系银鲫等7个鲫鱼品系线粒体DNA控制区的碱基组成、变异情况、序列结构和系统进化进行了比较分析。结果表明, 7个鲫鱼品系线粒体DNA控制区碱基的平均组成为A: (32.7±0.16)%, C: (20.4±0.37)%, G: (14.1±0.08)%, T: (32.8±0.36)%, 序列分歧率为0—5.7%, 其中红鲫和白鲫的分歧率最大(5.7%), 彭泽鲫、A系和D系银鲫之间最小(0)。洞庭青鲫与白鲫的分歧率为5.6%, 与彭泽鲫、A系和D系银鲫为2.2%, 与红鲫和普通鲫分别为0.8%和0.7%。对比哺乳动物线粒体DNA控制区结构, 并参照其他鱼类序列, 将7个鲫鱼品系的控制区分为终止序列区、中央保守区和保守序列区三个区域。同时识别了7个鲫鱼品系中一系列保守序列, 并给出了它们的一般形式。序列差异和系统进化分析表明, 在7个鲫鱼品系中, 洞庭青鲫与普通鲫和红鲫的亲缘关系最近, 与彭泽鲫、A系和D系银鲫亲缘关系次之, 与白鲫的亲缘关系最远, 而彭泽鲫、A系和D系银鲫三者在线粒体DNA控制区的相似性和分歧率上则表现为是同一个鲫鱼品系。