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水生态学杂志 2011
PCR-RFLP Analysis on Mitochondrial ND-5/6 Gene Polymorphisms of Natural Diploid and Tetraploid Loach(Misgurnus anguillicaudatus)
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Abstract:
摘 要:采用PCR-RFLP分析方法对洞庭湖、武汉两地的二倍体和四倍体泥鳅线粒体DNA ND-5/6基因多态性及4个群体遗传变异和遗传关系进行了研究。结果表明:120尾泥鳅mtDNA ND-5/6扩增片段长度均为2.2 kb;从13种限制性内切核酸酶中筛选出6种多态性内切酶(Hae III、Dra I、Rsa I、Taq I、Hinf I、Msp I)对扩增产物进行酶切,共检测到66种单倍型。泥鳅群体内单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.7679~0.9385和0.01041~0.03212,其中洞庭湖二倍体核苷酸多样性最高(0.03212),武汉二倍体其次(0.02452),二倍体群体内核苷酸多样性高于四倍体。群体间的核苷酸多样性(π)大小为0.02588~0.04144,平均值为0.031737±0.000005。群体间的核苷酸歧化距离(δ)大小为0.00462~0.01617,平均值为0.010659±0.000003,其中武汉二倍体和四倍体之间的核苷酸歧化距离最大(0.01617),武汉四倍体和洞庭湖二倍体之间的核苷酸歧化距离最小(0.00462)。Monte Carlo模拟χ2检验表明,4个群体间的单倍型频率存在极显著差异(p<0.0001)。UPGMA聚类分析表明,武汉四倍体、洞庭湖二倍体和四倍体聚为一支、亲缘关系较近,武汉二倍体为单独一支。