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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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A STUDY OF THE INFORMATIONAL PARAMETERS FOR THE SPECIFICSEQUENCES OF E.coli GENES AND YEAST GENES
大肠杆菌与酵母菌基因特定序列信息参量的研究

Keywords: Shine-Dalgarno region,Matrix representation,Informational parameter,Gene expression level,Conserved site
SD区域
,矩阵表示,信息参数,基因表达水平,保守位点,大肠杆菌,酶母菌,核酸序列

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Abstract:

提出核酸序列的矩阵表示形式,按位点定义了有生物学意义的信息参数M1(1)、M2(l)和M3(l)。着重研究了不同表达水平的大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)的SD序列(Shine-Dalgrno region,SD)以及大肠杆菌(E.coli)和酵母菌(Yeast)基因起始、终止密码子邻近区域核酸序列的碱基关联性与保守性。并求出相应矩阵的本征值,给出了信息参量与基因表达水平的关系。发现信息参量体现了原核生物和真核生物释放起始区域的显著差异,而且真核生物碱基起始区域的单碱基保守性程度及碱基关联性程度要比原核生物强。

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