基于结构比较的蛋白质同源模建系统及其评估Ⅱ侧链的安装

至今，有关蛋白质侧链的同源模建，除了在本体模板上安装侧链和少数限制条件下在同源模板上安装侧链的报道外，系统的研究和实施似乎还未见报道。本软件系统ＰＭＯＤＥＬＩＮＧ采用同源移植和“死端排除“相结合的侧链安装策略，对与模板蛋白相应践基具有相似大小和形状的目标残基采用直接移植的方法。其余铡链则用广义“死端排除定则”安装。经众多蛋白的测试，达到了较好的模建品质。