Digital gene expression profiling analysis of the early adventitious shoot formation in Arabidopsis thaliana
拟南芥不定芽发生早期的数字基因表达谱分析

目前，有关不定芽发生的研究主要集中在单基因的调控方面，缺乏转录组方面的系统研究。利用RNA-seq高通量测序技术在全基因组范围内检测了不定芽发生早期的基因表达谱，共检测到2 457个差异表达基因。这些基因参与了激素代谢和信号转导、愈伤组织和侧根的形成、茎顶端分生组织的发育和光合作用等过程。进一步的途径富集分析表明，不定芽发生早期苯丙氨酸代谢和苯丙胺素合成等途径相关的基因显著富集。并且苯丙氨酸可以显著抑制不定芽的发生，暗示了苯丙氨酸代谢和苯丙胺素的合成可能在不定芽发生过程起着重要的作用。