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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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RECOGNITIONS OF PUTATIVE BINDING SITES BASED ON INFORMATION CONTENT
基于信息量的调控元件预测方法

Keywords: Information content,Co-expression gene,Gene upstream region,Binding site,Cluster
信息含量
,共表达基因,基因上游区域,调控元件,聚类,基因转录

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Abstract:

设计基于信息含量的调控元件识别算法,对酵母的基因表达数据聚类结果进行分析,旨在预测共表达基因上游非编码区可能存在的转录因子结合位点。分析已知受相同调控因子作用的基因上游序列的结果表明,算法能正确识别具有单一保守核心序列的调控元件和具有间隔子(spacer)的保守序列.通过分析共表达基因,算法提取出的候选调控元件,部分可能具有生物学意义,这还有待于生物学实验的进一步验证。

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