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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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Recognition of β-hairpin motifs in proteins by using quadratic discriminant
用二次判别方法识别蛋白质β-发夹模体

Keywords: β-Hairpin motif,Scoring function,Increment of diversity,Auto-correlation function,Quadratic discriminant
β-发夹模体
,打分函数,离散增量,自相关函数,二次判别

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Abstract:

基于氨基酸序列,用打分值、离散增量、自相关函数值和距离值来表示β-发夹模体信息,通过二次判别方法对上述信息进行融合,预测数据库ArchDB40和EVA中的β-发夹模体。文章使用的β-发夹模体包含的loop长为2~10个氨基酸,当序列模式长为17个氨基酸时,对两个数据库中β-发夹5交叉检验预测的总精度分别达到83.1%和80.7%,相关系数达到0.59和0.61,好于前人的预测结果。

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