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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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MODELLING OF THE 3D-STRUCTURE OF MIRABILIS ANTIVIRAL PROTEIN (MAP) AND ITS SIMULATED REACTION WITH THE SUBSTRATE OLIGORIONUCLEOTIDE GAGA
紫茉莉抗病毒蛋白(Mirabilis antiviral protein,MAP)的空间结构和与底物相互作用的模拟研究

Keywords: MAP,Molecular modelling
紫茉莉抗病毒蛋白,结构模拟

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Abstract:

首先应用同源构筑方法建立了低序列同源性的紫茉莉抗病毒蛋白(MirabilisantiviralProtein,MAP)的空间结构,然后对此粗结构进行了分子动力学优化。最后通过对MAP,TCS与其底物类似物的相互作用,了解RIP特异糖苷酶活性的机制。结果表明模拟结构是合理的。RIP特异糖苷酶活性主要是由于酶的活性口袋与底物的特殊构象相互匹配。

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