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74株草菇遗传多样性分析
,邓优锦,刘新锐,谢宝贵
核农学报 , -1, DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2015.11.2084
Abstract: 为了保护和充分利用草菇遗传资源,利用RAPD、ISSR、SRAP3种分子标记对来源于不同地区的74个草菇菌株进行遗传多样性分析,并根据3种分子标记建立综合聚类图。结果表明:当相异系数D=0.28时,可将74个草菇菌株分为16个类群,其中有9个菌株各自为一类,其它类群包括多个菌株,最大的一个类群包括32个菌株。供试的74个菌株间的相异系数范围从0~0.79,具有较丰富的遗传多态性。74个菌株中只有V0020(26号)、V0059(71号)、V0060(72号)3个菌株的相异系数为0,而其它的菌株均有一定的差异性。3种分子标记各自的分析结果有差异,因此单独应用一种分子标记对种质资源进行遗传多样性分析,具有较大的局限性。本文综合运用RAPD、ISSR、SRAP3种分子标记,结果此3种分子标记单独分析更可靠。本研究可为其它物种间的遗传资源多样性分析提供新方法。
金针菇子实体颜色的遗传规律研究
谢宝贵,,吴文礼
菌物学报 , 2004,
Abstract: 以金针菇黄色菌株F19和白色菌株F8801为亲本,原生质体单核化获得两亲本的单核菌株,配对杂交获得F1,从F1的子实体分离单孢菌株,与两亲本的原生质体单核化菌株进行回交配对,出菇观察子实体颜色,分析菇体颜色的遗传规律。研究结果表明,黄色为显性、白色为隐性,菇体颜色受一对基因(Cc)控制,与不亲和性因子A或B都没有连锁。
早熟金针菇新品种‘农金6号’
刘新锐,谢宝贵*,,邓优锦
园艺学报 , 2014,
Abstract: 金针菇‘农金6号’是以黄色品种‘三明一号’与白色品种‘金21’、‘金3’为亲本,采用三亲本杂交选育而来,具有菇形好,生育期短,产量高,易管理,适应性广的突出特点。
57株毛头鬼伞遗传多样性分析
,谢宝贵,邓优锦,刘新锐,
菌物学报 , 2013,
Abstract: 运用SRAP、RAPD、ISSR3种分子标记技术对来源不同地区的57株毛头鬼伞Coprinuscomatus进行了遗传多样性分析,通过3种分子标记进行聚类分析,当相异系数D为0.48时,可以把57株毛头鬼伞分为4类:Ⅰ类包括Co0001;Ⅱ类包括Co0003;Ⅲ类包括Co0005;Ⅳ类包括其余54个菌种。供试的57个菌株间的相异系数范围从0–0.72,具有一定的遗传多态性。但其中有许多菌株两者之间的相异系数为0,说明毛头鬼伞菌种存在着比较严重的同种异名现象。
草菇子实体不同成熟阶段的比较蛋白质组学分析
刘靖宇,,谢宝贵,陈炳智,严俊杰
菌物学报 , 2014,
Abstract: 采用iTRAQ标记结合二维液相色谱串联质谱技术对草菇不同成熟阶段的差异蛋白质组进行研究。首先将提取的草菇不同成熟阶段蛋白样品进行SDS-PAGE分析,其次将经二维液相色谱串联质谱技术获取的串联质谱数据通过MASCOT软件搜库,之后对鉴定蛋白质数据进行了KEGG代谢通路分析。试验共计获得2335个不同肽段,鉴定到1039个蛋白质,其中1030个蛋白质具有定量信息。与蛋形期相比,在伸长期和成熟期阶段显著上调蛋白质85个,下调蛋白质103个。KEGG代谢通路分析结果显示,草菇不同成熟阶段中的68个差异蛋白质可定位于4种伞菌目模式真菌(灰盖鬼伞、双色蜡蘑、可可丛枝病菌和裂褶菌)的45个不同生物代谢途径,全景展示出草菇成熟阶段差异表达蛋白质定位的代谢网络。结果表明,iTRAQ标记技术结合二维液相色谱串联质谱可对不同生长发育时期的草菇蛋白样品进行有效地分离和鉴定。
四种重金属在金针菇栽培过程中的迁移规律
,黎志银,谢宝贵,邓优锦,刘新锐,肖淑霞
菌物学报 , 2014, DOI: 10.13346/j.mycosystema.130289
Abstract: 为了掌握铅、镉、砷、汞4种有害重金属元素在金针菇栽培过程中的富集和迁移,为金针菇产品质量控制提供依据。采用在培养料中添加一定量的铅、镉、汞、砷栽培金针菇,测定其在各栽培阶段培养料、金针菇子实体中的含量。结果表明,在试验的浓度范围内,金针菇子实体中4种重金属的含量随着培养料中添加量的增加而增加,说明金针菇子实体中4种重金属主要是来源于培养料,但金针菇子实体对不同重金属的吸收富集能力不同,对汞的吸收富集能力最强,富集系数最高达到7.590,富集能力大小依次为汞>镉>砷>铅。
草菇磷酸果糖激酶(PFK)基因克隆、结构及不同菌株中表达量分析
刘朋虎,谢宝贵,邓优锦,
菌物学报 , 2013,
Abstract: 从福建主栽品种屏优一号PY分离到2个不能正常出菇的单孢菌株PYd21、PYd15,二者配对杂交得到可正常出菇异核菌株H15-21。用solexa测序技术对PYd21基因组从头测序(denovosequencing),对PYd15、PYd21、H15-21的菌丝体分别进行数字基因表达谱测序,对8个样品(PYd15、PYd21、H15-21的菌丝体,H15-21出菇后的原基、钮扣期菌柄、蛋形期菌柄、伸长期菌柄和成熟期菌柄)mRNA等量混合物进行转录组测序。克隆测序了PYd21与PYd15中磷酸果糖激酶(PFK)基因,比对结果表明二者序列一致。利用转录组数据对PFK基因结构进行分析,结果表明:该基因全长3,494bp,有12个外显子、11个内含子;开放阅读框(ORF)全长2,457bp,编码818个氨基酸,5′端非翻译区(5′UTR)长度281bp,3′端非翻译区(3′UTR)全长103bp;RNA在加工过程中存在1种可变剪切类型、6个可变剪切位点。数字基因表达谱分析结果表明,PFK基因在PYd21、PYd15及H15-21中的标准表达量分别为71.08、120.61、251.85(transcriptpermillioncleantags,TPM),表达量依次升高,与菌丝生长速度显著正相关。并且异核菌株H15-21表达量高于2个单孢菌株之和,基因表达存在协同增效作用。采用实时荧光定量PCR技术对基因表达量进行验证,表达谱数据切实可靠。
香菇新品种‘农香2号’
刘新锐,杨彬,谢宝贵,,林喜强
园艺学报 , 2014,
Abstract: ‘农香2号’香菇是由福建野生香菇菌株l.0212与四川野生香菇菌株l.0249通过单—单杂交选育而来,朵形圆整,菌柄较细,产量高,鲜菇耐储藏,属中温中熟品种,可采用靠架式或覆土栽培。
银耳遗传转化标记
谢宝贵,朱虎,,饶永斌,郑金贵**
农业生物技术学报 , 2004,
Abstract:
草菇6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因可变剪接体克隆与表达分析
陈志宏,傅梅萍,李远峰,陶永新,,谢宝贵
应用与环境生物学报 , 2014, DOI: 10.3724/SP.J.1145.2014.04022
Abstract: 6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(6pgdh)是磷酸戊糖途径的限速酶,影响着细胞生命活动所需要的nadph的产生.为揭示草菇菌丝生长的分子基础,通过克隆草菇6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶编码基因(6gpdh)的可变剪接体,测序后进行生物信息学分析,利用表达谱和qpcr测定了它们在同核体和异核体菌株的表达量.结果显示,草菇6gpdh序列全长2315bp,含10个内含子,第6个内含子存在内含子保留的可变剪接.在同核体和异核体菌株中,内含子保留的可变剪接体表达量低,且菌株间没显著差异,而内含子被剪接的剪接体表达量高,且异核体菌株高于同核体菌株.两种可变剪接体具有6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶保守结构域和相似的三维结构.因此,初步分析两个可变剪切体是同工酶,内含子保留是组成型表达,表达量与菌丝生长快慢无关,内含子剪接是主效剪接方式,菌丝生长快的菌株表达量高,生长慢的菌株表达量低.图6表1参26
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