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生物化学与生物物理进展 2011
玉米黑粉菌cyp51稀有密码子和mrna二级结构分析及与杀菌剂戊唑醇分子对接Keywords: umcyp51,翻译起始区,稀有密码子,同源模建,分子对接 Abstract: 通过截短玉米黑粉菌cyp51(p450-14dm,umcyp51)基因(去除编码跨膜区部分)和选取不同的表达载体,构建了9种重组表达质粒,在大肠杆菌中进行umcyp51基因的表达,发现只有bl21(de3)/pet32-um-35重组表达工程菌获得了表达.对稀有密码子和mrna翻译起始区二级结构进行分析,结果表明稀有密码子和mrna翻译起始区二级结构对umcyp51蛋白的表达都有影响.适用于稀有密码子表达的菌株rosetta(de3)不利于umcyp51蛋白的表达;同时只有翻译起始区二级结构自由能值最低的重组载体pet32-um-35可以表达.为了设计以umcyp51为靶标的新型抗真菌抑制剂,基于最新解析的真核生物人类的cyp51晶体结构,利用同源模建的方法构建了umcyp51的三维结构并进行了分子动力学模拟优化.通过与商品化杀菌剂戊唑醇进行分子对接获得了此类抑制剂与umcyp51的理论结合方式,阐述了戊唑醇分子的杀菌机理,为开发新型的抗真菌抑制剂奠定了基础.
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