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ISSN: 2333-9721
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-  2016 

ITS2条形码序列对海南大戟科植物的鉴定

DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2016.09.021

Keywords: 大戟科 ITS2 DNA条形码 鉴定 PCR测序

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Abstract:

目的 利用DNA条形码技术评估ITS2序列对海南大戟科植物的鉴定能力。方法 利用PCR测序法,对供试样本ITS2片段进行双向测序,所得序列经Codon Code Aligner拼接后,利用MEGA 6.0进行相关数据分析,构建邻接(NJ)树。利用TAXON DNA软件分析序列种内、种间变异并作barcoding gap分析。从ITS2数据库中获得供试样本的预测ITS2二级结构。结果 大戟科供试样本ITS2序列中变异位点与信息位点分别占总序列长度的84%和69.67%。供试各种在构建的NJ树中均各自成束,表现出单系性;基于ITS2序列的种内最大变异距离值0.0673;种间最小变异距离值0.1191,各ITS2二级结构种内无明显差异;种间存在明显差异。结论 所得ITS2条形码序列对海南大戟科植物鉴定能力强,可作为DNA条形码序列对海南大戟科植物进行快速鉴定

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