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ISSN: 2333-9721
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-  2019 

灰毡毛忍冬LmPAL1基因的克隆及表达分析

DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2019.01.027

Keywords: 灰毡毛忍冬 苯丙氨酸解氨酶(PAL) 基因克隆 生物信息学 表达分析

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Abstract:

目的 克隆灰毡毛忍冬苯丙氨酸解氨酶(LmPAL1)基因全长序列,并进行生物信息学和表达模式分析。方法 提取灰毡毛忍冬花总RNA,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)和RACE技术克隆LmPAL1基因的全长cDNA序列;运用相关软件对该基因序列进行生物信息学分析;利用qRT-PCR测定灰毡毛忍冬茎、叶和不同花期花中该基因的相对表达量。结果 克隆的LmPAL1基因开放阅读框(ORF)长度为2 145 bp,编码714个氨基酸,生物信息学分析预测为亲水性蛋白,定位于叶绿体中,包含PAL shielding结构域(527~641 aa),并且含有PAL/HAL活性中心序列GTITASGDLVPLSYIAG(196~212 aa),与其他LmPAL1具有较高的相似度;LmPAL1基因qRT-PCR结果显示,7个花期材料以金黄色开花期相对表达量较高;与茎、叶比,白色花蕾期花的相对表达量最高,叶的最低。结论 成功克隆了LmPAL1基因,为进一步研究该基因的功能以及遗传改良灰毡毛忍冬品质奠定基础,同时为探究灰毡毛忍冬绿原酸生物合成和调节机制提供了依据

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