辣椒EST-SSR标记的开发与验证

摘要： 从NCBI数据库下载118 900条辣椒相关EST，对其进行SSR位点搜索，共搜索出3 343条SSR，分布密度为1/17.20 kb，共有287种重复基元。在辣椒EST-SSR中，二核苷酸（1 476个SSR）和六核苷酸（1 128个SSR）占主导地位，所占比例分别为44.15%和33.74%；出现最多的重复基元是GA/TC，占总数的14.30%，其次为CT/AG（94个，占8.11%）。针对3 343条含有SSR的EST设计合成了200对引物。用17份辣椒种质对200对引物进行筛选，196对引物有扩增产物，71对引物表现出多态性，共有220个多态性位点。利用71对多态性引物，对特定亲本P181-2-6和P230-2-5及其杂种一代F1的亲缘关系进行检测，结果说明从辣椒相关EST数据库中开发的SSR引物有较好的可用性