原核生物基因组肽编码sORFs分布及功能特征

近期，从非编码RNA中发现具有肽编码能力的小开放阅读框(sORFs)，激发了人们对这种长期被忽略的基因组元件的研究兴趣，sORFs迅速成为当前重点研究领域．由于表达水平及丰度低、序列短等因素，对肽编码sORFs的有效研究方法及数据资源还很缺乏，现有研究仅集中在少数真核模式生物，对自然界中广泛存在的原核生物研究非常少，肽编码sORFs的发现为目前精准背景下的基因组注释提出严峻挑战．在此背景下，本文首先系统研究了80余种不同类型原核生物中长度小于100个氨基酸的肽编码sORFs分布及功能特征，并对不同长度区间sORFs的序列组成、分布及进化特征进行了对比分析．结果表明，肽编码sORFs在原核生物基因组普遍存在，随着序列长度的降低，其序列复杂度降低，行使的生物功能也相对集中．在此基础上，进一步结合当前肽编码sORFs研究现状，深入总结了肽编码sORFs研究存在的问题及挑战，为今后肽编码sORFs研究奠定了坚实理论基础