拟南芥IQM5.2的克隆、表达及其生物信息学分析

摘要 为了探究拟南芥IQM5基因是否存在不同的剪切方式及其器官特异性表达，利用RT-PCR技术和T-A克隆发现了IQM5基因的一种新的剪切方式，即IQM5.2。利用生物信息学方法、半定量和定量RT-PCR分析方法分别对新的CDS序列所编码蛋白的性质以及IQM5.1和IQM5.2在不同器官中的比例进行了分析。结果表明，IQM5.2编码1个由300个氨基酸组成的多肽，其N端与豌豆重金属诱导蛋白6A（HMIP6A）具有较高同源性，含有1个IQ基序，属于钙不依赖性钙调素结合蛋白；在幼苗、莲座叶、花序叶、茎和花蕾中都存在IQM5.1和IQM5.2的转录本，且二者的比例在不同的材料中不尽相同。因此，IQM5基因存在不同的剪切方式和器官特异性表达