宇佐美曲霉木聚糖酶基因的克隆和序列分析

摘要 依据宇佐美曲霉(Aspergillus usamii)E001木聚糖酶(Xyn Ⅱ)N末端氨基酸残基序列以及曲霉菌密码子的偏爱性和真核生物mRNA在3'端存在Poly(A)等所提供的生物信息,采用RT-PCR技术扩增了Xyn Ⅱ成熟肽和3'非编码区的cDNA片段,PCR产物直接克隆至pUCm-T载体中.DNA序列分析表明,该cDNA全长733bp,其中3'非编码区178 bp,成熟肽编码区555 bp,编码184个氨基酸.成熟肽基因推导的氨基酸序列同As-pergillus niger、Emericella nidulans以及Trichoderma viride来源的木聚糖酶相比,同源性分别为89%、46%和36%.又进一步对Xyn Ⅱ二级结构进行了分析,并通过SWISS-MODEL预测了Xyn Ⅱ的三维结构