牦牛A-FABP基因的克隆与生物信息学分析

摘要 以牦牛的脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因为研究对象，根据GenBank收录的牛的A-FABP基因的mRNA序列设计一对特异性引物，以牦牛背最长肌为材料，采用RT-PCR方法克隆牦牛A-FABP基因的CDS区，并对其进行生物信息学分析。结果表明，牦牛A-FABP基因的CDS区全长399 bp，编码 132个氨基酸；其编码的蛋白属于亲水性蛋白。二级结构主要由α-螺旋、β-折叠、延伸链以及无规卷曲组成，含有11个磷酸化位点。牦牛A-FABP基因编码的氨基酸序列与黄牛和水牛的同源性最高且都为97%，与其他物种的同源性也较高，说明在进化关系上A-FABP氨基酸序列较保守，此蛋白序列具Cytosolic fatty-acid binding 家族蛋白功能结构域，无信号肽