适合转录组测序的葡萄叶片总RNA试剂盒提取法的改进

摘要 RNA试剂盒法是获取植物高质量RNA样品的常用技术, 针对3种常见RNA提取试剂盒在红地球葡萄叶样品RNA提取效果进行评估和优化, 以期找到适合红地球葡萄叶片RNA表达谱测序需求的高质量RNA提取策略。试验依据3种试剂盒推荐时间和条件进行RNA提取, 并对时间等条件进行优化, 比对了优化前后RNA质量。结果显示, 试剂盒经优化后的方法提取的RNA收率高, 完整性好, OD260/OD280在1.8-2.2之间, OD260/OD230大于2, 28S与18S条带清晰完整, RNA-Seq测序质量及基因覆盖度符合要求。在红地球葡萄叶片上的RNA提取结果表明, 延长提取试剂与样品的接触时间操作可以显著提高RNA提取质量(纯度/完整性)