盐芥EhKCR1 基因的克隆及表达分析

摘要 以山东生态型盐芥（Eutrema halophilum）为试材，采用电子克隆及RT-PCR 的方法，从中获得一个β-酮脂酰-CoA 还原酶基因全长cDNA，命名为EhKCR1，GenBank 登录号为JQ389855。EhKCR1 cDNA 长1 152 bp，含954 bp 开放阅读框架，编 码318 个氨基酸。采用生物信息学的手段对EhKCR1 蛋白的保守结构域、疏水性和二级结构等进行了分析。EhKCR1 蛋白具有 NADH 结合结构域［G（X）3GXG（X）3A（X）3A（X）2G］负责裂解的关键结构域［Y（X）3K］。序列比对和系统进化分析表明， 盐芥EhKCR1 基因与来源于拟南芥和油菜的KCR1 亲缘关系最近，与单子叶植物来源的KCR1 亲缘关系较远。Real-time PCR 分析 表明EhKCR1 受ABA 和干旱明显诱导。推测EhKCR1 与盐芥的抗逆有关