江西省钩端螺旋体分离株脉冲场凝胶电泳分型和分析

目的 采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术, 对江西省钩端螺旋体(钩体)患者及动物宿主中分离的钩体菌株型别进行分子流行病学调查。方法 利用核酸内切酶Not I对提取的钩体菌株染色体DNA进行酶切, 通过PFGE将DNA片段分离。获得的PFGE图像采用分析软件BioNumerics4.0进行处理并建立数字化数据库, 以相似度>75%为标准, 将获各钩体PFGE图谱与中国15群15型钩体参考标准株进行比较并进行聚类分析。结果 江西省不同地区的139株钩体可分为46个PFGE型, 优势型为LepNotI.0071、LepNotI.0072和LepNotI.0043型, 分别占所有钩体菌株的28.06%、15.11%和7.19%。139株钩体分离株中, 84.89%(118/139)菌株的PFGE图谱与6群6型中国钩体参考标准株基本相符, 其中32.37%(45/139)钩体菌株属于黄疸出血群赖型, 15.83%(22/139)和15.11%(21/139)钩体菌株分别属于澳洲群澳洲型和爪哇群爪哇型。结论 PFGE是一种快速、准确、高效的钩体分型方法。黄疸出血群赖型是江西省人群及动物中优势血清型, 澳洲群澳洲型和爪哇群爪哇型位于其次