大鼠脊髓损伤后脊髓组织中上调差异基因的生物信息学分析

摘要： 目的 探究大鼠脊髓损伤后脊髓组织中差异表达的上调基因及功能。方法 采用改良Allen法制备雌性Sprague-Dawley大鼠脊髓损伤模型，应用基因芯片技术检测在大鼠脊髓损伤后脊髓中差异基因的变达，运用基因本体论和基因组百科全书数据库分析差异上调基因、功能定位与通路。结果 脊髓组织总核糖核酸质量检测结果合格；基因芯片检测结果显示上调差异基因1874个，下调差异基因2348个；生物信息学分析上调差异基因的生物学过程、细胞组分和分子功能，涉及凋亡、免疫反应、炎症等，通路分析主要涉及磷脂酰肌醇三激酶-蛋白激酶B信号通路和Toll样受体信号通路等。结论 脊髓损伤后，上调差异表达基因可能参与脊髓损伤后的继发性反应，如炎症、免疫应答、缺氧等，继而影响脊髓损伤后的运动功能和感觉功能