厌氧氨氧化功能微生物PCR-DGGE分析方法优化

基于厌氧氨氧化(anaerobic ammonium oxidation，Anammox)开发的相关工艺在污水脱氮处理中具有重要作用；但Anammox微生物是一类目前尚不能分离和纯培养的微生物，分析其功能微生物的类型，对于研究其生物学机理并改良其工艺具有重要意义。本研究对变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis，DGGE)在Anammox微生物应用中的分析条件进行了优化，以提高PCR-DGGE的分析效果。结果表明，采用针对16S rDNA V3区的 GC-F341/R518引物组合，PCR最佳退火温度为64 ℃；DGGE电泳中，最佳上样量为5～7 μL，最佳胶浓度为8%，最佳电压/时间为80 V/16 h。优化后的PCR-DGGE具有准确性高和灵敏度好的特点