主要作物中PAL基因家族的鉴定和序列分析

苯丙氨酸解氨酶(PAL，phenylalanine ammonia-lyase ［EC：4.3.1.24］)存在于各种植物和部分微生物中，是与植物抗病性相关的关键酶，具有重要的植物生理意义。采用BLASTP的方法，依托全基因组数据库，获得了拟南芥［Arabidopsis thaliana (L.) Heynh.］、水稻(Oryza sativa L.)、玉米(Zea mays Linn.)、小麦(Triticum aestivum Linn.)、谷子［Setaria italica (L.) P. Beauv.］、大豆［Glycine max (Linn.) Merr.］6种植物中的PAL基因家族共45条序列，对其进行了系统进化分析、生物信息学分析等。分析结果显示：单子叶植物与双子叶植物分别聚集在不同的分支，说明单子叶植物水稻、玉米、小麦、谷子亲缘关系较近，双子叶植物拟南芥、大豆亲缘关系较近，而单子叶植物与双子叶植物亲缘关系较远，也说明PAL基因的分化在单子叶植物和双子叶植物分化前形成；酸性蛋白质占93.3%，稳定性蛋白占97.8%，有信号肽的蛋白占2.2%，有导肽的蛋白占4.4%，所有蛋白均为有明显跨膜现象的亲水性蛋白；所有PAL基因亚细胞定位于细胞质中，都有蛋白活性位点。分析结果为进一步研究作物中PAL代谢机理提供理论支持