基于宏基因组学16S rDNA测序对烟草根际土壤细菌群落组成分析

摘要 为了研究烟草根际土壤细菌多样性，了解其细菌群落的组成和结构，从而为健康植烟土壤生态系统的构建和保持提供理论依据和指导。以2014年四川凉山州健康烟株现蕾期根际土壤为研究样本，利用Illumina平台Miseq高通量测序技术对烟草根际土壤细菌16S rDNA进行高通量测序分析。结果表明：烟草根际土壤微生物多样性水平较高，不同样品间主要菌落分布结构相对稳定。在门分类水平上，共检测分类25个菌门，其中变形菌门占有明显优势(39.04%~53.71%)，其次为拟杆菌门、酸杆菌门、疣微菌门；在属分类水平上，共检测分类576类菌属，鞘脂单胞菌属、Flavisolibacter、Ohtaekwangia为烟草根际土壤细菌明显优势菌属。大部分主要菌群之间存在明显正相关关系，对烟草根际土壤细菌影响较大的环境因子为土壤速效氮、含水量和pH。运用宏基因组学16S rDNA测序技术获取的烟草根际土壤细菌信息较为丰富，为健康植烟土壤机制研究提供新的理论参考