1株NSP2蛋白5个氨基酸缺失的PRRSV遗传进化分析

【目的】研究新疆猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的遗传变异情况。【方法】提取PRRSV感染病猪肺脏RNA，通过RT-PCR方法对PRRSV NSP2部分基因和ORF5基因进行扩增、克隆和测序，分析其分子变异特征。【结果】成功克隆到1株PRRSV，命名为XJzx1株，其NSP2基因编码蛋白第472～476位存在5个氨基酸的连续缺失，有别于高致病毒株第482、533～561位30个氨基酸的典型缺失，位于经典毒株HB-2(sh)/2002第471～482位12个氨基酸缺失区域内；XJzx1与HK13株NSP2部分基因核苷酸序列相似性最高，为87.5%，系统进化树分析显示，XJzx1株与我国高致病毒株JXA1、HUN4、SX2009等同属一个分支；XJzx1 ORF5基因与我国经典毒株CH-1a、BJ-4、HK6等同属一个分支，其GP5蛋白不存在氨基酸的缺失或插入，而表现为多位点的突变。【结论】PRRSV XJzx1株具有独特的遗传进化特征，其毒性较经典毒株有所加强，推测为新型变异株