噪声性听力损失大鼠耳蜗miRNA调控网络分析
Analysis of microRNA regulatory network in rat cochlea with noise induced hearing loss by the next generation sRNA sequencing technology

摘要：目的　通过噪声性听力损失（NIHL）耳蜗差异性miRNA构建的基因调控网络，分析NIHL耳蜗的重要基因及功能，探讨NIHL的损伤机制。方法　6只SPF及SD大鼠通过110 dB SPL（6 h/d、24 d）的高斯白噪声暴露建立NIHL模型，6只SPF及SD大鼠非噪声暴露作对照，噪声暴露后7 d取实验大鼠耳蜗组织进行sRNA深度测序，分析差异性表达的miRNA，以差异最显著的8个miRNA依据靶基因数据库TargetScan、miRanda和miRDB共同预测的靶基因建立差异性表达miRNA的靶基因集，结合蛋白互作数据库构建miRNA调控网络，统计网络中每个基因相连基因的个数，确定相连基因个数大于30的基因作为NIHL大鼠耳蜗的重要基因，通过GeneCards数据库对重要基因进行功能注释。结果　（1）噪声暴露组大鼠永久性听阈位移水平（PTS）明显高于对照组（秩和检验：Z值-2097，P＜0.01）；（2）sRNA测序结果显示2组耳蜗差异性miRNA有148个［|log2（Fold Change）|＞1］，差异性最显著的8个miRNA为：rno-miR-378b、rno-miR-211-5p、rno-miR-133b-3p、rno-miR-29c-3p、rno-let-7c-2-3p、rno-miR-674-5p、rno-miR-495、rno-miR-3068-3p；（3）miRNA调控网络中的重要基因有11个：VEGFA、TNF、EGFR、FOS、NR3C1、AGT、CREBBP、PTK2、CD44、STAT3、IGF1。结论　NIHL大鼠耳蜗的11个重要基因通过调控细胞增殖与分化、控制细胞凋亡、改善组织细胞营养代谢、介导组织炎性反应以改善和修复耳蜗组织细胞。