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ISSN: 2333-9721
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求解蛋白质结构预测问题的局部搜索算法

Keywords: 蛋白质结构预测格点模型局部搜索跳坑局部搜索算法蛋白质结构预测问题carlo方法求解理论计算

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Abstract:

蛋白质结构预测问题是计算生物学领域的核心问题之一。通过理论计算的方法根据蛋白质氨基酸序列直接预测其空间结构是解决这一问题的有效途径。构造了新的邻域结构,采用了部分随机跳坑策略,对此问题提出了新的局部搜索算法。计算结果表明,该算法计算效率要优于传统的遗传算法和montecarlo方法。对于链长为50的算例还找到了文献中所没有的全新的最低能量构形。

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